奥迪A6L手动挡是从2009年开始提供的，但是正式上市是在2010－2013年间。奥迪A6L手动挡包括1.8T、2.0TFSI、3.0TFSI、3.0TD、4.2FSI等五款发动机，分别配备5速手动挡、6速手动挡以及7速双离合变速箱。其中1.8T和2.0TFSI都是采用5速手动挡，而3.0TFSI和3.0TD都采用6速手动挡，而4.2FSI则是采用7速双离合变速箱。它同时也是首款搭载MMI多媒体系统的奥迪A6L，内装配备了电子全景天窗、前双区自动空调等设施，改全景影像技术与GPS电子导航技术，让驾驶体验更加舒适、便利。