两新组织党建指导员是指负责指导新成立的非公有制企业、社会组织等两类新组织的党组织建设和党员队伍建设工作的专职人员。主要职责是协助两新组织党组织制定党建工作计划、组织开展各种形式的党建活动，引导党员履行职责，做好思想政治工作，推进两新组织党组织建设和党员队伍建设。