初三第二学期一般不建议休学，因为这个学期是升入高中的重要时期，学生需要为升学考试做准备。如果实在有特殊情况需要休学，需要向学校提出申请，并经过学校的审核和批准。同时，休学期间也需要按照学校规定的程序进行管理，如期归校并参加相关考试。