苹果短信删除不掉的原因可能有多种，包括短信被卡在了发送中、短信处于被锁定状态、短信数据损坏等问题。解决方法包括重新启动设备、检查短信设置、使用第三方工具进行修复等。如果问题仍然存在，建议联系苹果客服进行咨询和解决。