分子模拟是用计算机形象演示分子在多种微观力作用下将会如何运动的研究工具。Monte Carlo模拟，是先把分子随便地放置，然后每次随机移动一些分子。如果系统总能量降低就必定移动；如果升高，则升高越多，移动成功率越小。如此反复移动到系统总能量最低时，即获得分子的热力学平衡态分布。