生防细菌防治植物病害发生发展的一个重要机制是产生拮抗物质。生防细菌的拮抗物质种类多，作用范围广谱。同一种拮抗物质可以由多种细菌菌株产生，而同一细菌也可以产生多种不同结构的拮抗物质。
自1945年Johnson等报道枯草芽孢杆菌产生抗菌物质后，半个多世纪以来人们从枯草芽孢杆菌的不同菌株中发现了60多种抗生素。枯草芽孢杆菌产生的抗菌物质大多为低分子抗菌肽，有环状肽或环状脂肽，也有线状肽，分子量约1000 Da(介于300~3 000 Da)，但也有一些为蛋白类拮抗物。