蛋白质组学的核心内容之一就是蛋白质鉴定。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析(如Edman 降解法)费时费力、通量低,存在不容易实现规模化和自动化,结果灵敏度差等问题。当前主流的基于软电离技术的液相色谱-质谱系统(LC-MS/MS)是实现高通量蛋白组全谱鉴定的主要方法。
适用范围
某一生理状态下组织、细胞或者细胞器中所有表达蛋白质的鉴定
要求物种含有已完成全基因组测序或转录组测序注释的CDS信息
客户提供
需鉴定的样品;
样品信息单,需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。
最终交付
实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
生物信息学分析内容包括:
1. 多肽、蛋白质鉴定;
2. 鉴定结果特征分析:肽段程度分布、蛋白鉴定覆盖度、unique肽段数分布等;
3. GO功能分类、COG功能注释、Pathway通路注释;
4. 蛋白质网络互作预测(高级分析);
5. 蛋白质Domain分析(高级分析)