公元1518年，明武宗正德十三年。一个盛夏日，雨湖上有位不住叹气的渔翁，手中的渔网里，除了一块大石头，别无他物。正发愁没有鱼能给即将临盆的妻子补身子，忽而，石头开始说话，告诉他赶紧回家，妻子已经生了，这新诞的婴儿，便是流芳后世的药圣——李时珍。
李时珍带着普济世间疾病苦难而来，终其一生的任务，便是整理编纂《本草纲目》。只是，凡人肉胎若要尝遍百草，危险性极大，需要神明力量助其剥离毒性，于是上天派遣了四王天的仙娥——花仙孟瑞儿，随后降到人间，在李时珍看不到的维度里，朝夕陪伴他，为他辟毒引毒，保证他的人身安全。
孟瑞儿的灵体是一株瑞香花，此花又称千里香，飘逸之远，人若多闻则被催眠，有诗为证：“小槛移秀色，端来媚禅房，道人不解饮，醺然醉天香。”这种飘香，不仅能为李时珍缓解疲惫，保障他的休息，还能完整飘送世间百草的气味，以便李时珍能更容易发现有价值的百草。此外，瑞香花全株有毒，天庭的瑞香花，其毒性更甚，可以压制、吸取、化解世间各种花草植被之毒，达到以毒攻毒，以毒致胜的目的。所以保护药圣的重任，非她莫属。