今天(2021年9月27日),BEAM终于公开了其管线中迟迟没有宣布的项目,用CBE治疗乙肝。
我们知道,目前Vir和箭头等,利用RNAi和抗体疗法,可以大幅降低乙肝病毒的表面抗原HBsAg。病毒的干扰弹减少后,患者本身的T细胞就有望重新激活来杀死受感染的肝细胞。
但是这个疗法还是有一个明显的不足,即无法破坏或者清除受感染肝细胞中的cccDNA。要知道乙肝病毒是非常狡猾的,一方面会将其基因复制后随机的插入宿主细胞的DNA中,另一方面,其还会产生cccDNA,以游离的形态存在于宿主细胞的细胞核中作为后备。因此,无法破坏或者清除受感染肝细胞中的cccDNA的话,乙肝病人永远存在一定的复发风险。
虽然目前已经有药物来抑制cccDNA的活性,但要直接对付,甚至清除这些cccDNA的话,那就必须使用基因编辑技术。大部分读者一定会想,为何之前那么多CRISPR公司没怎么开展治疗HBV的项目呢?因为HBV将其基因复制后插入宿主细胞的DNA时,是有很大的可能性会随机插入到若干个不同的位置的。因此,当直接使用CRISPRCas来对付cccDNA产生DSB的话,不光会破坏cccDNA,还有可能使宿主细胞的DNA同时产生多个DSB,因此发生translocation和其它geneticrearrangements的风险会急剧上升,这样一来就有很大的致癌风险。
而如果使用CBE的话,同时发生多个DSB的风险就会大幅下降。同理,使用CBE相对直接使用CRISPRCas还有另一个好处,即可以实现multiplexediting,在多个位置同时编辑产生stopcodons,确保cccDNA被沉默。而CRISPRCasmultiplexediting的话,其发生translocation和其它geneticrearrangements的风险会进一步上升。
根据Beam目前公布的数据来看,
MultiplexingtwogRNAsdesignedtointroducestopcodonsledtosubstantial,simultaneousreductionofrelevantHBVviralmarkers(HBsAg,HBeAg,HBVDNA,3.5kbRNA)
DualgRNAcccDNA-targetingCBEledto30%-60%editingefficiencyofthecccDNA,withoutreducingcccDNAlevels;
Combinatorialtreatmentofthebaseeditingreagentswithstandardantivirallamivudineresultedin20%higherbaseeditingefficiencyleadingtohighantiviralefficacy;and
BaseeditingpreventedHBVreboundinlong-terminfectedprimaryhepatocytes.
编辑效率可能为30%-60%+20%(withlamivudine)。那么问题也很明显,即这最高80%cccDNA的编辑率真正的疗效有多高?虽然Beam也表示“BaseeditingpreventedHBVreboundinlong-terminfectedprimaryhepatocytes.“,但到底能多大程度上彻底阻止病毒反弹也还不好说。希望Beam能进一步提高这个cccDNA的编辑效率。另外,Beam也可以尝试和Vir和箭头等公司合作,联合使用RNAi和抗体疗法,说不定效果也会更好一些。
我们知道,目前Vir和箭头等,利用RNAi和抗体疗法,可以大幅降低乙肝病毒的表面抗原HBsAg。病毒的干扰弹减少后,患者本身的T细胞就有望重新激活来杀死受感染的肝细胞。
但是这个疗法还是有一个明显的不足,即无法破坏或者清除受感染肝细胞中的cccDNA。要知道乙肝病毒是非常狡猾的,一方面会将其基因复制后随机的插入宿主细胞的DNA中,另一方面,其还会产生cccDNA,以游离的形态存在于宿主细胞的细胞核中作为后备。因此,无法破坏或者清除受感染肝细胞中的cccDNA的话,乙肝病人永远存在一定的复发风险。
虽然目前已经有药物来抑制cccDNA的活性,但要直接对付,甚至清除这些cccDNA的话,那就必须使用基因编辑技术。大部分读者一定会想,为何之前那么多CRISPR公司没怎么开展治疗HBV的项目呢?因为HBV将其基因复制后插入宿主细胞的DNA时,是有很大的可能性会随机插入到若干个不同的位置的。因此,当直接使用CRISPRCas来对付cccDNA产生DSB的话,不光会破坏cccDNA,还有可能使宿主细胞的DNA同时产生多个DSB,因此发生translocation和其它geneticrearrangements的风险会急剧上升,这样一来就有很大的致癌风险。
而如果使用CBE的话,同时发生多个DSB的风险就会大幅下降。同理,使用CBE相对直接使用CRISPRCas还有另一个好处,即可以实现multiplexediting,在多个位置同时编辑产生stopcodons,确保cccDNA被沉默。而CRISPRCasmultiplexediting的话,其发生translocation和其它geneticrearrangements的风险会进一步上升。
根据Beam目前公布的数据来看,
MultiplexingtwogRNAsdesignedtointroducestopcodonsledtosubstantial,simultaneousreductionofrelevantHBVviralmarkers(HBsAg,HBeAg,HBVDNA,3.5kbRNA)
DualgRNAcccDNA-targetingCBEledto30%-60%editingefficiencyofthecccDNA,withoutreducingcccDNAlevels;
Combinatorialtreatmentofthebaseeditingreagentswithstandardantivirallamivudineresultedin20%higherbaseeditingefficiencyleadingtohighantiviralefficacy;and
BaseeditingpreventedHBVreboundinlong-terminfectedprimaryhepatocytes.
编辑效率可能为30%-60%+20%(withlamivudine)。那么问题也很明显,即这最高80%cccDNA的编辑率真正的疗效有多高?虽然Beam也表示“BaseeditingpreventedHBVreboundinlong-terminfectedprimaryhepatocytes.“,但到底能多大程度上彻底阻止病毒反弹也还不好说。希望Beam能进一步提高这个cccDNA的编辑效率。另外,Beam也可以尝试和Vir和箭头等公司合作,联合使用RNAi和抗体疗法,说不定效果也会更好一些。