从目前的研究结果来看，不管是局部注射还是全身性注射，不管是自体干细胞还是异体干细胞，机体均会逐渐清除干细胞，清除速度与多因素有关，包括机体免疫系统、输入途径、细胞来源的组织、细胞供体的年龄、细胞体外培养时间的长短等。
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　　同时也因为干细胞趋化性的特点，健康机体和损伤机体的分布也不太一样，如果机体有多处损伤的话，干细胞到达某一损伤部位的数量也会不一样，尤其是有些隐形的疾病或损伤是我们所不能预见的，可能我们需要针对解决的部位成了漏网之鱼，因为干细胞并不能分辨某种损伤的严重程度，无法进行先急后缓的修复策略。
　　因此，干细胞在用于疾病治疗的时候，可能单次的回输效果会不太明显或者不能持久，需要我们像传统药物治疗一样，进行一个疗程的治疗。医生会根据患者的病情制定一个详细的治疗方案，具体进行几次，多久一次，一次多少量，这个都是根据患者量身定制的，目的就是在首次治疗取得一个比较明显的效果后再通过后续的治疗来巩固效果较终达到从量变到质变的目的。