主要分为医用类多肽药物，肽类抗生素，疫苗，农用类抗菌肽，饲料小肽，日化用化妆品，食品用大豆多肽，玉米多肽，酵母多肽，海参肽。
从功能角度来分，可以分为，降压肽，抗氧化肽，降胆固醇肽，类鸦片活性肽，高F值寡肽，食品强味肽等等。
活性肽，与营养，荷尔蒙、酵素抑制、调节免疫、抗菌、抗病毒、抗氧化有非常紧密关系。多肽大体上分为:多肽类药物和多肽类保健品。传统的多肽类药物主要是多肽类激素，2011年对多肽类药物的开发已经发展到疾病防治的各个领域，特别是在以下各领域发展较快。
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