1. 尿道开口不正常尿道口可出现在正常尿道口近端至会阴部尿道的任何部位，影响正常站立排尿，一些患儿甚至必需以下蹲的姿势排尿。
2.阴茎下弯即阴茎向腹侧弯曲，不能正常排尿和性生活。导致阴茎下弯的原因有阴茎腹侧纤维性挛缩及海绵体发育弯曲畸形。
3.包皮的异常分布阴茎头腹侧包皮因未能在中线融合，故呈V形缺损，包皮系带缺如，全部包皮转至阴茎头背侧呈帽状堆积。
依尿道口开口位置可分为4型：1、阴茎头型、冠状沟型：尿道口位于冠状沟的腹侧，多数仅伴有轻度阴茎弯曲，少数有重度阴茎下弯。
2、阴茎体型：尿道口位于阴茎腹侧从冠状沟到阴茎阴囊交接处之间，多数伴有阴茎弯曲。
3、阴茎阴囊型：尿道口位于阴囊部，常伴有阴囊分裂，阴茎弯曲严重。
4、会阴型：尿道口位于会阴部，阴囊分裂，发育不全，阴茎短小而弯曲，常误诊为女孩。
近年来按阴茎下弯矫正后尿道口的退缩位置来分型的方法被很多医师接受。
伴发畸形
严重的尿道下裂患儿常伴有其他畸形，部分患儿合并阴茎阴囊转位、隐睾、腹股沟疝，重度尿道下裂部分伴发前列腺囊、重复尿道等，少数患者可合并肛门直肠畸形。