综述类论文是科学家的重要资源。它们可以提供一个领域的历史背景,以及关于该领域未来发展的个人看法。同时,撰写这类文章可以为自己的研究提供灵感,还可以做一些写作练习。
不过,很少有科学家接受过如何写综述类论文的训练,或者不知道一篇优秀的综述文章是怎样构成的。甚至选择要使用的合适软件也是一个棘手的决定。
近日,《自然》杂志访问了一些“老手”和“新手”,讨论如何撰写高被引综述文章。
1. 主题聚焦 避免术语
▲ 新加坡南洋理工大学化学和生物医学工程领域助理教授赵文婷(音译):
研究生时期的综述写作提高了我对所在领域历史的了解。我还了解到领域研究中未曾遇到的挑战,从而激发了一些灵感。读博期间写的第一篇综述促使我去研究如何修饰纳米颗粒的表面特性,以增强生物传感。
博士后期间,这段经历让我发现了细胞膜曲率的作用,发表了研究论文,还让我聚焦到现在的研究上。如果没有写那篇综述,我可能不会在这个领域开始。
学生在写第一篇综述时普遍存在的一个问题是,他们往往过于“雄心勃勃”。我的建议是接受“综述文章并不是教科书”这一点:你的文章应该对主题有更集中的讨论,跳过一些话题是可以的,这样就不会分散读者的注意力。学生们也应该考虑编辑的截止日期,尤其是受邀撰写的综述,确保文章讨论的范围不要太广,以免耽误写作。一篇好综述还应该避免使用行话,并为刚接触该领域的人解释基本概念。虽然我的专业是工程学,但我对生物学很感兴趣。我的研究方向是开发纳米材料来操纵细胞膜上的蛋白质,以及了解纳米材料如何影响衰老和癌症。
作为一个“局外人”,我发现对这些生物学主题最有用的是那些用通俗易懂的科学语言写成的综述文章。
2. 注重过程 拓展“个性”
▲ 伊利诺伊芝加哥大学化学系副教授田博之:
在我的实验室里,我们首先会问:这篇综述的目的是什么?我写一篇综述的理由包括,有机会为科学界提供见解,为自己的研究寻找机会。写综述还是训练早期职业研究人员“软技能”的一种方式,比如项目管理和领导能力。对于主要作者来说尤其如此。在确定了一篇综述文章的需求和目的之后,我会组建一个团队,尽量让不同专业领域的学生参与进来,从而获得不同的观点。
之后,我会和团队共同提出一个大纲,多次反复讨论,以确保充分浏览了文献,且不会重复在其他综述中出现过的讨论。同样重要的是,这些大纲不是由我一个人决定的:学生们经常会有他们可以拿来讨论的新想法。一旦讨论完毕,我们就开始写作。我经常提醒学生,把自己想象成“科学艺术家”,并鼓励他们发展写作和表达信息的方式。添加更多词汇并不总是最好的方法,例如我喜欢用表格来总结研究进展,同时规划未来的研究轨迹。
再比如,在综述论文中加入短视频,以突出一些关键方面。这可以增加读者群和可读性,因为视频更容易在社交媒体平台上分享。
3. 守时+数据 结果大不同
▲ 《自然评论物理》编辑Ankita Anirban:
作为一名期刊编辑,我的职责之一是评估提交的综述文章框架。最好的架构是,能够及时、清楚地解释为什么读者应该关注所提出的主题。一篇综述如果仅对最新文献增长进行总结并不够:最有趣的综述反而是提供了关于该领域分歧讨论的那些文章。科学家经常围绕着数据撰写研究论文,但当撰写综述时,数据就不那么受重视了。但在我看来,综述中的数据比大多数人认为的更重要。我最喜欢的一篇综述文章就把来自多篇研究论文(其中许多直接相互矛盾)的数据结合在一起。然后用这些数据来确定大趋势,并提出可以解释所有不同结论的基本机制。
综述文章的一个重要作用是向研究人员介绍一个新的领域。因此就像演讲的第一张幻灯片一样,概述性的数据有助于解释所讨论的科学内容。
4. 保持更新 开言纳谏
▲ 韩国科学技术高等研究院助理教授YOOJIN CHOI:
2018年读博期间,我开始撰写题为《利用微生物细胞和噬菌体进行无机纳米材料的生物合成》的综述。为了提供最新的、原创性的综述文章,我必须与最新研究保持同步。当时,我用的是谷歌学术,于是把它设置为每天根据关键词更新相关文献。在此过程中,我也学会了更开放地接受批评,以提高文章的价值,增加阅读量。
最初,我的综述只关注于利用细菌等微生物细胞制造纳米材料。当第一份同行评议报告返回时,3位审稿人都建议将综述范围扩大到另一种生物工厂:噬菌体。它们本质上是感染细菌的病毒,也可以用来制造纳米材料。这些反馈最终引导我讨论了各种生物工厂(噬菌体、细菌、真菌和微藻)之间的差异及其优缺点。这是一个很好的补充,因为它使综述更加全面。
写这篇综述也让我产生了利用纳米修饰微生物生产化学品的想法,这也是我现在的研究课题。
5. 善用技术
▲ 英国剑桥大学博士生PAULA MARTIN-GONZALEZ:
今年年初,我的博士导师和我决定写一篇综述文章,讨论将医学成像与基因组学相结合以改善卵巢癌的管理。在研究这篇综述的时候,我注意到一个趋势,即一些论文不断被该领域的其他论文引用。
我很清楚,这些论文一定很重要,但作为整合癌症生物学领域的新人,我很难立即找到并阅读所有这些“重要论文”。
于是,我编写了一个小应用程序提高文献研究的效率。使用这个代码,用户可以输入要查询的关键词,然后应用程序搜索PubMed等数据库中保存的所有以这些关键词为特征的相关文献。代码会识别出相关的论文,并创建一个在搜索结果中引用的所有参考文献的引用图表。该软件突出显示了与搜索中的其他论文有许多引用关系的论文,因此可以称为重要论文。代码极大地改善了我组织论文的方式,并让我了解到研究领域的关键出版物和新发现。否则,这些资料会花费我更多的时间,也需要更充足的领域内经验。
我在GitHub上分享了代码后,一些反馈提出对于不习惯编码的研究人员来说,这可能会令人望而生畏。因此,我希望建立一个更友好的网页界面,类似于PubMed或谷歌学术。在那里,用户可以通过简单的查询检索生成引文图表。
不过,很少有科学家接受过如何写综述类论文的训练,或者不知道一篇优秀的综述文章是怎样构成的。甚至选择要使用的合适软件也是一个棘手的决定。
近日,《自然》杂志访问了一些“老手”和“新手”,讨论如何撰写高被引综述文章。
1. 主题聚焦 避免术语
▲ 新加坡南洋理工大学化学和生物医学工程领域助理教授赵文婷(音译):
研究生时期的综述写作提高了我对所在领域历史的了解。我还了解到领域研究中未曾遇到的挑战,从而激发了一些灵感。读博期间写的第一篇综述促使我去研究如何修饰纳米颗粒的表面特性,以增强生物传感。
博士后期间,这段经历让我发现了细胞膜曲率的作用,发表了研究论文,还让我聚焦到现在的研究上。如果没有写那篇综述,我可能不会在这个领域开始。
学生在写第一篇综述时普遍存在的一个问题是,他们往往过于“雄心勃勃”。我的建议是接受“综述文章并不是教科书”这一点:你的文章应该对主题有更集中的讨论,跳过一些话题是可以的,这样就不会分散读者的注意力。学生们也应该考虑编辑的截止日期,尤其是受邀撰写的综述,确保文章讨论的范围不要太广,以免耽误写作。一篇好综述还应该避免使用行话,并为刚接触该领域的人解释基本概念。虽然我的专业是工程学,但我对生物学很感兴趣。我的研究方向是开发纳米材料来操纵细胞膜上的蛋白质,以及了解纳米材料如何影响衰老和癌症。
作为一个“局外人”,我发现对这些生物学主题最有用的是那些用通俗易懂的科学语言写成的综述文章。
2. 注重过程 拓展“个性”
▲ 伊利诺伊芝加哥大学化学系副教授田博之:
在我的实验室里,我们首先会问:这篇综述的目的是什么?我写一篇综述的理由包括,有机会为科学界提供见解,为自己的研究寻找机会。写综述还是训练早期职业研究人员“软技能”的一种方式,比如项目管理和领导能力。对于主要作者来说尤其如此。在确定了一篇综述文章的需求和目的之后,我会组建一个团队,尽量让不同专业领域的学生参与进来,从而获得不同的观点。
之后,我会和团队共同提出一个大纲,多次反复讨论,以确保充分浏览了文献,且不会重复在其他综述中出现过的讨论。同样重要的是,这些大纲不是由我一个人决定的:学生们经常会有他们可以拿来讨论的新想法。一旦讨论完毕,我们就开始写作。我经常提醒学生,把自己想象成“科学艺术家”,并鼓励他们发展写作和表达信息的方式。添加更多词汇并不总是最好的方法,例如我喜欢用表格来总结研究进展,同时规划未来的研究轨迹。
再比如,在综述论文中加入短视频,以突出一些关键方面。这可以增加读者群和可读性,因为视频更容易在社交媒体平台上分享。
3. 守时+数据 结果大不同
▲ 《自然评论物理》编辑Ankita Anirban:
作为一名期刊编辑,我的职责之一是评估提交的综述文章框架。最好的架构是,能够及时、清楚地解释为什么读者应该关注所提出的主题。一篇综述如果仅对最新文献增长进行总结并不够:最有趣的综述反而是提供了关于该领域分歧讨论的那些文章。科学家经常围绕着数据撰写研究论文,但当撰写综述时,数据就不那么受重视了。但在我看来,综述中的数据比大多数人认为的更重要。我最喜欢的一篇综述文章就把来自多篇研究论文(其中许多直接相互矛盾)的数据结合在一起。然后用这些数据来确定大趋势,并提出可以解释所有不同结论的基本机制。
综述文章的一个重要作用是向研究人员介绍一个新的领域。因此就像演讲的第一张幻灯片一样,概述性的数据有助于解释所讨论的科学内容。
4. 保持更新 开言纳谏
▲ 韩国科学技术高等研究院助理教授YOOJIN CHOI:
2018年读博期间,我开始撰写题为《利用微生物细胞和噬菌体进行无机纳米材料的生物合成》的综述。为了提供最新的、原创性的综述文章,我必须与最新研究保持同步。当时,我用的是谷歌学术,于是把它设置为每天根据关键词更新相关文献。在此过程中,我也学会了更开放地接受批评,以提高文章的价值,增加阅读量。
最初,我的综述只关注于利用细菌等微生物细胞制造纳米材料。当第一份同行评议报告返回时,3位审稿人都建议将综述范围扩大到另一种生物工厂:噬菌体。它们本质上是感染细菌的病毒,也可以用来制造纳米材料。这些反馈最终引导我讨论了各种生物工厂(噬菌体、细菌、真菌和微藻)之间的差异及其优缺点。这是一个很好的补充,因为它使综述更加全面。
写这篇综述也让我产生了利用纳米修饰微生物生产化学品的想法,这也是我现在的研究课题。
5. 善用技术
▲ 英国剑桥大学博士生PAULA MARTIN-GONZALEZ:
今年年初,我的博士导师和我决定写一篇综述文章,讨论将医学成像与基因组学相结合以改善卵巢癌的管理。在研究这篇综述的时候,我注意到一个趋势,即一些论文不断被该领域的其他论文引用。
我很清楚,这些论文一定很重要,但作为整合癌症生物学领域的新人,我很难立即找到并阅读所有这些“重要论文”。
于是,我编写了一个小应用程序提高文献研究的效率。使用这个代码,用户可以输入要查询的关键词,然后应用程序搜索PubMed等数据库中保存的所有以这些关键词为特征的相关文献。代码会识别出相关的论文,并创建一个在搜索结果中引用的所有参考文献的引用图表。该软件突出显示了与搜索中的其他论文有许多引用关系的论文,因此可以称为重要论文。代码极大地改善了我组织论文的方式,并让我了解到研究领域的关键出版物和新发现。否则,这些资料会花费我更多的时间,也需要更充足的领域内经验。
我在GitHub上分享了代码后,一些反馈提出对于不习惯编码的研究人员来说,这可能会令人望而生畏。因此,我希望建立一个更友好的网页界面,类似于PubMed或谷歌学术。在那里,用户可以通过简单的查询检索生成引文图表。