在中国植被分区上，霍山县属于落叶、阔叶一常绿阔叶混交林带。有木本和草本植物3000多种，其中用材林有200多个树种，以松、杉和竹类为主，次之有栎、杨、柳、槐、枫、檀、榆、椿、桦、泡桐等树种；经济林有100多个树种，以板栗、油茶、油桐、乌桕为大宗。药用植物有1600多种，其中珍稀名贵和大宗地道药用植物有霍山石斛、安徽贝母、杜仲、厚朴、人参、桔梗、枣皮、断血流、药百合、野菊花、何首乌等，霍山石斛为名贵特产。观赏植物有1100多种，其中观赏价值高或分布较广的有雪松、鹅掌楸、天女花、杜鹃花、广玉兰、白兰、含笑、夜来香、望春花、腊梅、菊花、桂花、兰花等。牧草有几十种，以芭茅、野蒿和巴根草居多。
以上各类植物中，属国家Ⅰ级重点保护的野生植物有银杏、香果树；国家Ⅱ级重点保护的野生植物有大别山五针松、刺楸、鹅掌楸、榉树、连香树、杜仲、厚朴；国家Ⅲ级重点保护的野生植物有天女花等。省级重点保护的野生植物有三尖杉、金钱松、领春木、天目木姜子、青檀、粗榧、银雀树、青钱柳、小勾儿茶、醉翁榆、琅琊榆、天竺桂、天目木兰、巨紫荆等。其他珍稀濒危树种及花草有蝴蝶树、樟树、紫楠、大别柳、红豆杉、黄山杜鹃、都支杜鹃、云锦杜鹃等。