前排围观

2、贝姐的身份。透子和贝姐的关系。
绯色篇留下来的巨坑，那时候透子话没有说完就被打断了。透子：没想到你居然是boss的……而且为什么透子一死，贝姐和boss的关系就会泄露在组织内部。

前排

不过boss是谁知道了以后这坑不但没有减少反而还多了。

朗姆

3、板仓卓的巨坑，还有后面的猫梗。
最神秘最有名的一个巨坑，这里就不多说了。那个软件到底是什么？又是做什么的？和APTX4869又是什么关系？贝姐跟板仓打电话时带着猫进来的那个人又是谁？是boss还是rum或者又是谁……

4、我们既是上帝也是恶魔……
最最神秘和有名的一个巨坑，隐藏在软件巨坑当中的一个更大的巨坑。组织的目的到底是什么？哀第一次和柯南还有少侦三人看球赛时说的话又是什么意思？

我今天开了一个脑洞是沙朗，，那就是贝姐的老妈就是boss，而贝姐变装成她妈妈再被人识破，就能造成她妈妈已死的假象。沙朗想返老还童，宫野夫妇造出的银弹却只能保留年龄，小哀凭残卷造出aptx4869，但是本该是主要作用的返老还童变成了副作用，主作用变成大部分人吃了就死。这也能解释为什么小哀说她本不想造毒药，也能解释既是上帝又是恶魔。但是解释不了贝姐为什么要杀小哀不过都只是脑洞

٩(* ఠO ఠ)=

5、这是一个只有在剧场版里面出现的坑
Gin你们的阿帕奇武装直升机还有鱼鹰是从哪来的？而且除了m5以外，其他和组织有关的剧场版都有武装直升机的出现。

镇楼的故事未必是真的。也许当年这里确实发生过惨绝人寰鲜血横流的惨剧，但这个故事很可能本身只是配合舆论掩盖而杜撰出来的，也许有没有两个人来过都存疑（甩锅捏造出的两个陌生人很简单啊）。说不定就是当年组织在这里试验什么神秘药物（什么不老药啊仙丹啊，反正是对达官贵人有吸引力的就是了），于是那些各界大佬们纷纷云聚于此，但是实验失败，基本全场死绝了。为了掩人耳目和“权贵们的体面”杜撰出了这么一个故事。

第一个那个只是他们编的故事而已，事实上是乌丸召集了各界精英帮他解密，最后没有得到答案就把他们都灭口了

而且就boss是不是真的死了也是个谜吧。