影响营养吸收
乳中含有人体骨骼、肌肉、器官、大脑等生长发育必不可少的微量元素。因乳糖不耐无法吸收奶中营养和厌奶的婴幼儿一般都会出现营养不良的各种症状，如缺钙、缺锌、缺铁和贫血症状等。
影响智力发育
乳糖在乳糖酶作用下形成的半乳糖是宝宝大脑发育必不可少的物质，长期乳糖不耐受影响婴幼儿大脑智力发育。
引发肠道问题
由于乳糖不耐受，喝奶后，奶在婴幼儿体内无法被分解消化，引发肠胃问题。长期乳糖不耐受易导致小儿难治愈的慢性腹泻，部分患儿会诱发尿布疹。
造成发育迟缓
早期乳糖不耐的婴幼儿会产生吐奶、腹泻、便秘、肠鸣、腹胀、腹痛、排气、等问题.易产生哭闹等现象，乳糖不耐得不到及时治疗会造成婴幼儿厌奶，影响其生长发育。