《沙门不敬王者论》之智慧二
（三）
理论至此其实已经很圆满了，只是从现实的角度出发，人们还是不能完全地接受，对慧远法师的言论还有诸多疑惑。在此，慧远法师又是非常巧妙的给予一一回应。
首先，人们疑惑的一点是，佛教的理论认为人们如果不按照佛教教义进行不顺应自然的修行，就要陷入生死轮回的循环中而不得超脱。这里有一个假设：即使形体灭亡了，而神，即灵魂是不会灭亡的。可是根据人们惯常看法，形存则神存，形灭则神灭。如果是这样的，那么佛教的理论基石就要崩塌，佛教的一切理论都要陷于虚无。因为“夫禀气极于一生，生尽则消液而同无。神虽妙物，故是阴阳之所化耳。既化而为生，又化而为死。既聚而为始，又散而为终。”（同上）佛教对“神要受苦难所累”的担忧显得就是杞人忧天了，为超脱生死轮回而不顺应自然的举动也是多余的。质疑者为了形象说明这一点，还通过薪火的例子加以说明：木头在，那么就一直燃烧；如果木头没有了，那么火也灭了。
可是，慧远法师告诉他们事实并非如此，形与神之间的关系，不是他们所想象的那样，他说道：“神也者，圆应无生，妙尽无名，感物而动，假数而行。感物而非物，故物化而不灭。假数而非数，故数尽而不穷。”（同上）
就是说，神这个东西，它感应变化而无生灭，微妙至极不能名状。神感应外物而活动，借助生命形质而运行。它感应万物而自己却不是物，所以外物消亡而自己却不会灭亡；借助生命形质而运行，自己又不是生命形质，所以生命形质消失了而自己也不会穷尽。
这里，慧远还“以其人之道还治其人之身”，他仍用薪火的比喻来加以说明。他告诉人们木和火的比喻本来源自于佛教的典籍，但在流传中被湮没了，所以人们不知道它本来的深奥旨趣。木与火之间正确的关系应该是这样的：“火之传于薪，犹神之传于形。火之传异薪犹神之传异形。前薪非后薪，则知指穷之术妙。前形非后形，则悟情数之感深。”（同上）不明白的人看到形体死亡了，就以为神和情欲都灭亡了，就像看到一根木头上的火烧完了，火和木头永远不存在一样。可见世人之愚昧。
用到人身上，慧远认为如果人之受到本源之气是一样的，那么按照名教神形俱变的说法，那么重华（虞舜）就应该和他的父亲（瞽叟）一样愚蠢，可是事实上并非如此；当时的统治阶级与普通百姓，甚至乞食卑微者之间都应该没什么差别，这显然又是无法接受的。质疑者观点之荒谬由此可见一斑。“固知冥缘之构，著于在昔。”（同上）可见，现实当中多种多样的人在生前就已经决定了，他们并不是秉守同样的气。
佛教在南北朝之时，通过道安等人的努力，基本上已经厘清了旧时“格义”的弊端，使得佛教在学理上独立于儒、道二家而流行。至慧远之时，以《沙门不敬王者论》一篇，运用其智慧，通过上文所述之巧妙手段，树立了佛教自身的独立性，使得佛教独立于王权存在，避免了“无上道服毁于尘俗，亮到之心屈乎人事”，而保持了宗教的出世神圣性。从此，佛教在中国，走上了独立发展的道路，中华佛教亦由此开始，成为世界佛教之重要一宗。慧远《沙门不敬王者论》，可谓中国佛教发展史上极为重要之“护法”“护教”经典，其影响意义非凡。