输卵管积水会影响生育能力。在以下三个方面：在简单的生物力学水平上，当输卵管被液体和肿胀堵塞时，卵子就不能通过，精子也不能正常移动与卵子相遇进行受精。即使只有一根输卵管受到影响，来自该管的输卵管液也可能在子宫内积聚，妨碍胚胎的植入或对胚胎有毒害作用。
虽然试管受精完全绕过输卵管，将胚胎直接植入子宫，但输卵管积水未经治疗的妇女成功进行试管受精的机会并不大。未接受治疗的输卵管积水患者的IVF妊娠率不到接受治疗的输卵管积水患者IVF的一半。她们也会遭遇更多的流产。这可能是由以下几个因素造成的:
输卵管积水是有毒的。这意味着即使是体外受精，输卵管积水也可能损害胚胎的健康。
这种液体可能会干扰子宫内膜，使其不易接受植入胚胎。
流入子宫的液体可能会机械地冲洗掉移植的胚胎。