染色体异常是导致女性容易自然流产的其中一个重要原因，但目前由于人们对染色体筛查的认识不足，所以主动检查染色体的夫妇并不多。
　　自然流产是一个复杂的问题，但如果反复流产二次以上，就是习惯性流产。在一般情况下，一个生育期的妇女，如果习惯性流产，采用一般检测手段没有发现疾病的，应考虑夫妇中某一方是否染色体异常。有数据显示，在自然流产中约有40%是由于胎儿染色体异常引起的。
　　据统计约70%通过自然受孕的胚胎在出生前最容易丢失。一个重要原因是染色体异常的胚胎丢失，包括流产，被称为“非整倍体，其中有一个或多个染色体的亏损或收益。阵列CGH(比较基因组杂交)囊胚染色体检查与R技术支持。CGH站的比较基因组杂交和Array CGH是最新技术检查整个一个单细胞的染色体数目，染色体不平衡，尤其是没有任何收益或亏损的DNA在整个细胞的DNA检查方法。
　　A-CGH是胚胎在试管中培养到第5天到第6天时，对已经发育成的囊胚进行46条(22对 X Y)染色体进行全部检测，只要有一根染色体有问题，就不再被移植，做这个检测的淘汰率较高，但剩下的都是精英。被移植的精英囊胚着床率及生育率极高，从而大大降低了胎停及流产风险。说实话，做试管成着床但停育的人非常多，包括现在35岁以上的女性自然怀孕的流产率也高，就是因为高龄产妇的胚胎染色体更容易发生变异，因此，A-CGH应该被染色体易位人群强烈考虑。
　　一般染色体CSS检查是有必要的，染色体数目异常见于多倍体、三倍体、单倍体及三体型等;染色体结构异常见于易位、断裂、缺失、重复和倒位等。尤其染色体平衡易位是造成自发性流产的主要原因之一。同源染色体易位携带者生育患儿的风险率可达100%，且死胎和流产的比例很高。自发性流产夫妇的染色体异常可发生于男方或女方。
美国SCRC中心专家提示，如果平衡易位携带者为男性，那么生育染色体不平衡的胎儿风险率相对较女性携带低。因为男性携带者有一个选择性受精问题，即男性正常精子比异常精子优先受精，男性产生的精子数量多，异常精子多被排斥，而较少引起流产。而女性卵子数量有限，没有选择的机会，所以反复流产患者的染色体异常多发生在女方。对有自发流产史及家族中有自然流产史者，要高度警惕染色体异常的可能性、不提倡盲目保胎，以免畸形儿的出生。通过做试管婴儿是比较安全的成功率也会提高的。