直属附属医院
济宁医学院附属医院（综合性三级甲等）鲁西南地区领先、在全国有较大影响的知名品牌医院
非直属附属医院
济宁医学院附属济宁市第一人民医院（三级甲等）
济宁医学院第二附属医院(济宁市精神病防治院，山东省安康医院)
国内享有较高的声誉
济宁医学院附属滕州医院(滕州市中心人民医院) 三级综合医院，为济宁医学院附属医院，泰山医学院硕士研究生培训基地
济宁医学院附属湖西医院(单县中心医院)（三级乙等）
济宁医学院附属金乡医院(金乡县人民医院)（二级甲等）
济宁医学院附属枣庄市立医院 国家三级甲等综合性医院、国际爱婴医院、济宁医学院附属医院
济宁医学院附属日照市人民医院
济宁医学院附属高唐县人民医院 二级甲等综合医院
济宁医学院附属济南市第三人民医院 二级甲等医院
济宁医学院附属医院（综合性三级甲等）鲁西南地区领先、在全国有较大影响的知名品牌医院
非直属附属医院
济宁医学院附属济宁市第一人民医院（三级甲等）
济宁医学院第二附属医院(济宁市精神病防治院，山东省安康医院)
国内享有较高的声誉
济宁医学院附属滕州医院(滕州市中心人民医院) 三级综合医院，为济宁医学院附属医院，泰山医学院硕士研究生培训基地
济宁医学院附属湖西医院(单县中心医院)（三级乙等）
济宁医学院附属金乡医院(金乡县人民医院)（二级甲等）
济宁医学院附属枣庄市立医院 国家三级甲等综合性医院、国际爱婴医院、济宁医学院附属医院
济宁医学院附属日照市人民医院
济宁医学院附属高唐县人民医院 二级甲等综合医院
济宁医学院附属济南市第三人民医院 二级甲等医院
