镶嵌工艺更是一种非常复杂的工艺，将凤眼菩提的眼球部分挖掉，然后替换以绿松石，南红玛瑙或者红珊瑚等等珍贵的宝石，也有以眼角为线镶嵌一圈宝石的，这样制作的凤眼菩提非常漂亮，颜色多样，并且，就算是品质不好，眼型不正的凤眼菩提，镶嵌过后，也是美轮美奂的。