细菌蓝白斑筛选原理：
IPTG为安慰型诱导物，可诱导β-半乳糖苷酶的产生，X-gal是β-半乳糖苷酶的作用底物，在β-半乳糖苷酶的作用下X-gal被切割成半乳糖和深蓝色的物质：5-溴-4-靛蓝，有色物质可使所在的菌落呈现蓝色。
但当含有lac启动子的质粒中插入了外源基因，则不能产生β-半乳糖苷酶，因此不能分解X-gal产生蓝色底物，所在的菌落呈现白色（相对蓝色），这样的菌落才有可能是我们想要的菌株。蓝白斑筛选减轻了在筛选阳性克隆菌落时的工作量。