上了中學的小櫻，有天做夢夢到小櫻牌上的圖案都消失了，一名神秘人物出現之後，小櫻還聽到玻璃破裂的聲音。
小櫻從這個夢醒來後，翻開封印之書，發現裡面的小櫻牌都變成透明的了！
面對身邊再度發生的奇妙事件，在與知世、小狼和艾利歐的討論下，小櫻重新踏上了蒐集透明牌之路。
這次小櫻要使用在夢中獲得的新魔杖，迎向全新的挑戰！