慢性咳嗽的病因较为复杂，不仅涉及呼吸系统，有些还与耳鼻喉、消化系统疾病等有关。 其常见病因有上气道咳嗽综合征、咳嗽变异性哮喘、嗜酸细胞性支气管炎、胃食管反流病，其次有血管紧张素转换酶抑制剂诱发的咳嗽、病毒感染后气管高反应性、支气管扩张、支气管内膜结核、肺癌、成人百日咳、心因性咳嗽、结节病等等，极为少见的还有由甲状腺疾病引起。 专家介绍说，由于慢性咳嗽患者的伴随症状少，X线检查又没有什么异常，所以误诊率相当高。“根据呼研所的一项调查，临床上约有76%的慢性咳嗽患者曾被误诊为‘慢性支气管炎’或‘慢性咽炎’，92%的人曾经使用抗生素治疗，平均就诊时间为3年，最长为20年，较高就诊次数为100次。
