在天然水体中，N元素以游离态氮、有机氮、硝酸态氮、亚硝酸态氮、总氨态氮等几种形式存在，一般来说，硝酸态氮、亚硝酸态氮、氨（铵）态氮是一切藻类都能直接吸收利用的氮源。通常情况下，藻类首先吸收NH₄⁺，而NO₃-－N 吸收能力相对较差，同时水体中的固氮菌也能吸收转化水中的氮。
氨氮的来源：
一是水源；
二是来自各种肥水产品；
三是饲料中的可溶蛋白融入水中；
四是养殖生物的粪便。