药食同源植物提取物具有益生元作用，即一方面除了能选择性刺激肠道内有益菌的生产或增强有益菌的活性，另一方面还应不被有害菌利用。含有β-糖苷键的药食同源植物多糖，如枸杞多糖、茯苓多糖可开发成药食同源植物的特色益生元。此外，多酚类物质同样可以促进双歧杆菌和乳酸菌等有益生菌的生长，选择性地抑制致病菌生长，优化肠道菌群结构，调节肠道微生态平衡。