C-DRG和CN-DRG的分组原则不同，C-DRG的分组基础是疾病分类与代码（GB/T14396-2016），即中国ICD-10国标版”、“中国临床疾病诊断规范术语集”和“中国医疗服务操作分类与编码（CCHI）”。CN-DRG分组的基础是ICD10和ICD9，各个分组器支持的ICD10版本不一，基本所有版本都有对应的分组器相对应，个人觉得CN-DRG更适合目前实施环境。
医院使用的CN-DRG其实主要是应用于院内绩效管控，与医保DRG的支付并不会有太大的冲突，医院可以正常使用自己的DRG即可。当然如果需要和医保的DRG保持一致，进行预分组，可以选择和医保局相同的版本即可。