在初发病时，皮损发展及增多较快，因扁平疣的疣体中有大量活跃的病毒。当局部被搔抓时，疣体表面和正常皮肤可产生轻微的破损，这时病毒很容易被接种到正常皮肤上而产生新的疣体。
扁平疣具有传染性，疣体在患处进行扩张，当患者有意无意地搔抓患处，结果发现疣体越来越多，甚至沿抓痕呈串珠状排列或密集成片。