日本汉方，源自中国医学，但也有其特点。主要有三派：古方派、后世方派、折中派。
古方派主要研究医圣张仲景的伤寒杂病论用方，人称不变的经方。后世方派研究并运用最多的，主要是明代医家龚廷贤的〈万病回春〉，以及宋代官修方书《太平惠民和剂局方》。折中派则是取以上二派之长。再就是：日本汉方名家的经验方或者家传方。
日本汉方古方派三大特点：一用量小，大概是我国常用量的五分之一；二原方运用，尽量用原方，即使加减也有统一标准，便于传承、学习、交流、验证。三重视腹诊，腹诊为用方第一指征。