青少年牙周炎的病因尚未明了，目前已知的是一种叫放线杆菌的微生物是此病的主要致病菌，它们通过产生某些细胞因子杀死人体白细胞，阻碍白细胞到达感染部位。同时，它们还可产生毒素侵犯牙周组织，破坏牙周组织，引起牙槽骨吸收。该病有家族遗传倾向，患者多有白细胞功能缺陷。