据济宁公共资源交易网显示,兖州南站站房主体结构为钢筋混凝土框架结构体系,屋面为钢网架结构,主体结构耐久性:高架站房100年,其他站房50年;建筑结构安全等级为一级;建筑耐火等级:地面以上为二级,站台柱、雨棚二级,地下建筑为一级。2016年11月,中国曾发布《新建鲁南高速铁路曲阜南站等8座客站建筑概念设计方案征集信息公告》。3月13日,中国铁路经济规划研究院又发布了最新版本的《新建鲁南高速铁路曲阜南站等8座客站建筑概念设计方案征集信息公告》,再次对鲁南高铁8座客站的建筑规模和车场规模进行公示。2017年5月,中国铁路经济规划研究院又对鲁南高铁8座车站进行澄清,其中第一个就是兖州南站。通过对比两份公告,在新修建的8个高铁站中,兖州南站比原计划的5000平米,扩大了8倍,现在扩大到40000平米。据了解,曲阜东站的建筑面积为9996平方米,新建的兖州南站是其4倍。