生理性卵巢囊肿的分类1——肿瘤性卵巢囊肿
肿瘤性卵巢囊肿既然是肿瘤就有良性和恶性，囊性、实性之分，卵巢恶性肿瘤的病死率较高，居妇科肿瘤的首位，因此一旦确定是卵巢肿瘤，即使是卵巢的囊性肿瘤，如浆液性囊腺瘤、粘液性囊腺瘤、良性囊性畸胎瘤等，虽大多为良性，但有转化为恶性的可能，因此均需早期手术切除。
生理性卵巢囊肿的分类2——非肿瘤性卵巢囊肿
非肿瘤性卵巢囊肿又称非赘生性卵巢囊肿，大多是卵巢的功能性囊肿，包括**囊肿、黄体囊肿、黄素囊肿、炎症性卵巢囊肿、多囊卵巢以及子宫内膜异位囊肿（即卵巢巧克力囊肿）。