第二，气象条件不利。北极航线的气象海象不稳定且恶劣，所以无法稳定航运。
冬季是无法使用的，尽管全球气候在变暖，但并不是一年四季冰雪都在融化。夏季通航时间也不稳定，年份差异很大，解禁和结束的日程不可预测，通航区域也随着年份和时间发生变化。
即使通航季内，也会受到恶劣天气的影响。高纬度带容易陷入气候不稳定和恶劣状况。严重的，秋季以后是低气压的高发时间带，夏季也受到浓雾的影响。虽说有雷达和卫星定位系统，仍然需要警惕流冰。在浓雾中航行，速度无法提高。这就使得航运日程变得不稳定。定期航运的前提是，能够在确定的日期和时间出港，在确定的日期停靠各地。
如果时间上不确定，就无法使用。不仅无法制定物流计划，而且还会发生额外的成本。