花椒进入衰老期，表现树势衰弱，骨干枝先端下垂，出现大枝枯死，外围枝生长很短，都变为中短果枝，结椒部位外移，产量开始下降。但衰老期是一个很长的时期，如果在树体刚衰退时，能及时对枝头和枝组进行更新修剪，就可以延缓衰退程度，仍然可以获得较高的产量。衰老期修剪的主要任务是：及时而适度地进行结果枝组和骨干枝的更新复壮，培养新的枝组，延长树体寿命和结果年限。
为了达到以上目的，首先应分期分批更新衰老的主侧枝，但不能一次短截的过重，造成树势更弱。应分期分段进行短截，待后部分复壮后，再短截其它部位。其次，要充分内膛徒长枝、强壮枝来代替主枝，并重截弱枝留强枝，短截下部枝条留上部的枝条。对外围枝，应先短截生长细弱的，采用短截和不剪相结合的办法进行交替更新，使老树焕发结果能力。
衰老树更新修剪的方法，依据树体衰老程度而定，树体刚进入衰老期时，可进行小更新，以后逐渐加重更新修剪的程度。当树体已经衰老，并有部分骨干枝开始干枯时，即需进行大更新。
小更新的方法是对主侧枝前部已经衰老的部分，进行较重的回缩。一般宜回缩在4~5年生的部位。选择长势强、向上的枝组，作为主侧枝的领导枝，把原枝头去掉，以复壮主侧枝的长势。在更新骨干枝头的同时，必须对外围枝和枝组也进行较重的复壮修剪，用壮枝壮芽带头，以使全树复壮。
大更新一般是在主侧枝1/3~1/2处进行重回缩。回缩时应注意留下的带头枝具有较强的长势和较多的分枝，有利于更新。
当树体已经严重衰老，树冠残缺不全，主侧枝将要死亡时，可及早培养根茎部强壮的萌蘖枝，重新构成树冠。一般选择不同方向生长的强萌蘖枝3~4个，注意开张角度，按培养主侧枝的要求进行修剪，待2~3年后，把原树头从枝干基部锯除，使萌蘖枝重新构成丛状树冠。
如树势长偏及时设法纠正，一般放任树的枝干都较直立，应采取撑、拉、别、坠等方法或在修剪时注意留枝条等，使之长出角度大的新枝；还可采用背后枝换头的方法，开张角度，要使开张的角度向偏少方向延伸。更重要的是要充分利用一切可以利用的枝条，扩大偏少部分的树冠，使之尽快达到全树平衡。另外还要加强管理，使树势很快恢复，开始正常生长。
修剪时首先剪去干枯枝、过密枝、病虫枝，注意对剪下的病虫枝一定要烧毁，以免继续繁殖传染。
花椒树的萌枝力较强，所以对老树还可以采取伐后萌蘖更新，让其长出新的枝条，重新培养树冠。这样从根部萌发的新树，第二年以后则可重新结果，采用这种方法培养的新椒树，仍可继续结果15-20年。
在修剪过程中，一般不要锯大枝，因为大枝是树体的骨干枝和主体，轻易锯掉后很难再长成，也会削弱树势，影响结果。如大枝非锯不可，则锯口一定要平整光滑，并在锯口上涂抹保护剂（接蜡、波尔多液等）。
对老花椒树根系的修剪，可用树冠外缘深翻断根法对根系修剪，促发新根。具体做法是：在树冠外缘的下垂处，挖1条深、宽各为50~100cm的环状沟，挖沟时遇到直径1.5cm粗的根系时将其切断，断面要平滑，以利伤口愈合。根系修剪时期以9月下旬至10月上旬效果较好，有利于断根愈合和新根形成。修根量每年不可超过根群的40%，或以达到1.5cm粗根系的1/3为宜。施肥要及时适量，以满足产生新根所需的养分。