疼痛是NUSS手术后最常见的并发症。术后早期比较明显，程度较重，有些患者甚至必须用止疼药才能控制。随着时间的推移，疼痛会逐渐减轻，但常常很长时间才会消失。
术后疼痛的原因有很多，最根本的原因是创伤。在NUSS手术中，凹陷的胸壁被钢板强行顶起，使患者“健康”的肋骨出现不同程度的“变形扭曲”，严重者甚至会出现骨折，这种病变本质上类似于将正常的骨格强行扭曲甚至折断的情形，其损伤的程度是可想而知的。这样的情况下能一点不疼痛吗？
NUSS手术一直被公认为所谓的微创手术，这其实只是个相对的概念而已。传统的漏斗胸手术，比如胸骨翻转手术，或者其它形形色色的成形手术，都有比较大的切口、比较大的创面以及比较大的术野，这样手术的创伤显然比NUSS手术要大得多。于是人们便据此而将NUSS归并于微创手术了。这让NUSS手术“占了很大的便宜”。
手术的创伤是一个非常复杂的概念，其大小除了与切口的大小、机械损伤的范围等可见因素有关外，尚与很多无形的因素有关，比如手术的时间、手术过程中内环境的状况、切口内部结构损伤的范围与程度以及重要脏器损伤的程度等因素，都直接关系到手术损伤的程度。所以评价一种手术损伤的大小，是一个非常复杂的工程，需要综合很多因素进行评价。但非常可悲的是，很多医生经常仅用切口的大小来衡量这个概念。这不但会把自己搞糊涂，更会误导病人。
临床上经常见到的情况是，为了追求微创的效果，不少医生总是尽量缩小手术切口，有些甚至完全采用腔镜技术实施手术。这种做法的出发点是没有丝毫毛病的，因为切口的缩小，至少可以使疤痕缩小，使术后局部尽可能美观。这是无可厚非的。但是，切口的缩小意味着操作难度的增加，有时还会增加手术潜在的风险，这对医生的技术提出了更高的要求。
对于技术熟练的医生来说，即使是在腔镜下手术，也可以保证手术安全快捷地完成。这无疑是患者的福音。但非常不幸的是，多数临床医生并不是在自己将技术完全把握熟练之后才开始在病人身上动刀子的，而是边练习边学习边犯错误边成熟的。这就难免出现事故了。尤其是当一些生手做手术的情况下，手术的时间可能会成倍数倍地延长，而被华丽的小切口掩盖之下也许是内部大范围的损伤，更不要说可能出现的致命失误了。所以严格地说，切口很小的手术不过是小切口手术罢了。这样的手术可能是微创的，但绝对不全是微创手术。你能说切一寸皮肤的损伤程度与切一寸心肌的损伤程度相同吗？而很多情况下，为了在小切口中完成手术操作，医生不得不在切口内部做很多操作，比如极力将切口牵开，其强度往往是大切口中牵拉强度的很多倍。这意味着什么？不意味着切口局部更大的损伤吗？
NUSS手术就是典型的如上类型的小切口手术。这种手术外面口子非常小，但内部动作却非常大，将整个胸廓的前半部分大幅度顶起。这样的手术创伤会小吗？所以将NUSS手术说成是微创手术只是人们对小切口手术的一种误解罢了。这种手术的创伤不但不小，事实上是非常巨大的。那么，如此大的损伤，术后出现疼痛就在所难免了。这也正是多数病人都有疼痛的根本原因。
一般来说，NUSS手术术后疼痛有明显的分期，大致分为三个阶段。第一个阶段，出现在术后的早期，也就是住院期间。这个时期疼痛比较明显，虽然不是严重的刺痛，却经常难以忍受，不得不借助药物止痛。这种情况在术后的前三天最为明显。此后疼痛会逐渐减轻变得可以忍受。这个时期的疼痛白天往往不是特别明显，到了晚上就会加重，常常严重影响休息。第二个阶段主要是术后1到2个月内，主要是隐痛，不持续，多在动作过大的时候出现，平时不太明显。过了这个阶段，就进入第三个阶段，疼痛会明显减少，不少病人会完全消失，偶尔会有少数病人依然有疼痛存在，极少数甚至会持续几个月甚至一直到钢板取出。
止疼最有效的办法是使用止痛药物，但不是最理想的选择。由于多数患者的疼痛是一个比较长的过程，如果动辄便使用止痛药的话，轻则出现耐药，重则出现成瘾，后果不堪设想。所以理想的止痛方法不是用药而是另外的方法，即让自己坚强，
不少漏斗胸患者是在青少年甚至幼儿时期完成的手术，这样的年龄要想真正坚强起来是非常困难的。作为家长，既要体谅孩子的病痛，尽可能从各方面帮助孩子渡过难关，又不能过于迁就孩子。多给些精神上的鼓励，对孩子渡过这个困难时期是非常重要的。