神经递质不仅仅在大脑充当“信使”，它们在外周神经系统（比如肠道神经）内也发挥着举足轻重的作用，而它们功能上的紊乱在有时也会直接影响排便过程，造成腹泻。
　　如某些药物具有引发腹泻的不良反应，就是因为它们能够刺激一些神经递质（如乙酰胆碱、胃动素）在肠道的释放，神经递质又为肠道神经施加了不恰当的蠕动信号，腹泻就此产生。