真性红细胞增多症发病隐匿，病程缓慢，未经治疗的患者中位寿命为1.5年。经过治疗后，中数生存期可达10~15年以上。真红在病程中可发生各种转化，包括其他骨髓增殖性疾病（原发性血小板增多症，骨髓纤维化，慢性白血病）和急性白血病。一旦转化为急性白血病，各种治疗效果均差，通常在数月内死亡。真红的死因多见于血栓，栓塞并发症，占30%-40%，其他依次为骨髓纤维化，急性白血病，实体瘤，出血，晚期可出现骨髓衰竭。