一 DNA测序技术-原理及技术
a)第二代测序技术：Illumina，454, Ion Torrent原理
b)第三代测序技术：PacBio, Hellicos原理
c)第四代测序技术：Oxford NanoPore原理
d)Hybridization based methods
e)测序技术的比较及展望
二 基因组编辑技术（CRIPR技术）
a)不同基因组编辑技术的比较Meganuclease，ZFN，TALEN，
b)CRISPR-Cas9
c)CRISPR-Cas系统的作用机理
d)CRISPR-Cas系统在基因组编辑中的应用
e)CRISPR-Cas系统的其他应用
三 生物信息学基本实验技能
a)Linux常用命令
b)EMBOSS，经典序列分析工具集
c)Perl编程基础
四 小RNA（microRNA）研究方法及案例
a)实验流程
b)数据处理比对
c)靶基因富集分析
d )miRNA-mRNA关联分析
e)主要工具包的使用：miRDeep，mirDeep*
五 长非编码RNA（lncRNA）研究方法及案例
a)实验流程
b)lncRNA的发现和分类
c) 功能分类
d)主要工具包的使用：lncRScan，LncRNAFunction等
六 表观遗传学研究方法及案例
a )DNA methylation, MeDIP-seq
b )Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo
c )Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq
d )Chromatin accessibility, DNase-seq
e )3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C
七 基于DNA/RNA测序技术的功能基因组学研究策略分析
a )ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq
b )RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq
c )Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d
d )Smart-Seq2
e )Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq
主办单位： 中国科学院计算技术研究所 计算技术转移中心
官方网址： http://ec.ict-ttc.com
地 点： 西安交通大学
联系方式： 联系电话/传真： 010-58032566
联系人： 朱老师 15340035496
邮 箱： zkyjsjs@163.com
a)第二代测序技术：Illumina，454, Ion Torrent原理
b)第三代测序技术：PacBio, Hellicos原理
c)第四代测序技术：Oxford NanoPore原理
d)Hybridization based methods
e)测序技术的比较及展望
二 基因组编辑技术（CRIPR技术）
a)不同基因组编辑技术的比较Meganuclease，ZFN，TALEN，
b)CRISPR-Cas9
c)CRISPR-Cas系统的作用机理
d)CRISPR-Cas系统在基因组编辑中的应用
e)CRISPR-Cas系统的其他应用
三 生物信息学基本实验技能
a)Linux常用命令
b)EMBOSS，经典序列分析工具集
c)Perl编程基础
四 小RNA（microRNA）研究方法及案例
a)实验流程
b)数据处理比对
c)靶基因富集分析
d )miRNA-mRNA关联分析
e)主要工具包的使用：miRDeep，mirDeep*
五 长非编码RNA（lncRNA）研究方法及案例
a)实验流程
b)lncRNA的发现和分类
c) 功能分类
d)主要工具包的使用：lncRScan，LncRNAFunction等
六 表观遗传学研究方法及案例
a )DNA methylation, MeDIP-seq
b )Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo
c )Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq
d )Chromatin accessibility, DNase-seq
e )3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C
七 基于DNA/RNA测序技术的功能基因组学研究策略分析
a )ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq
b )RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq
c )Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d
d )Smart-Seq2
e )Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq
主办单位： 中国科学院计算技术研究所 计算技术转移中心
官方网址： http://ec.ict-ttc.com
地 点： 西安交通大学
联系方式： 联系电话/传真： 010-58032566
联系人： 朱老师 15340035496
邮 箱： zkyjsjs@163.com
