龟的消化系统主要是由消化道和消化腺两大部分组成。

1.气管 2.食道 3.胃 4.十二指肠 5.胰腺 6.肝 7.胆囊 8.小肠 9.盲肠 10.脾 11.大肠 12.肾 13.肛囊 14.肛门 15.膀胱 16.输卵管 17.卵巢 18.心脏 19.肺
消化道可分为口腔，食道，胃，十二指肠，小肠，大肠，直肠，肛门。龟类口裂的上下颌无牙，仅被角质鞘覆盖，近似鸟喙，口颌内缘角质鞘增厚而在切缘处相当锐利口腔底部有阔而短的肉质舌，但不能伸缩，在舌的表面有角质状的突起，具有阻留食物及感触的功能，口腔内有唾液腺仅具有润湿食物功能并无消化作用。
龟类的食道较长约为整个消化道长度的九分之一，其内壁上皮也有角质状乳突 乳突的尖端向食道下端方向，成倒刺状分布具有阻抑食物返回口腔的功能食道下端与胃连接，胃为V型带状物，上为喷门，下为幽门，胃位于体腔前左内侧而香右延伸，整个胃被肝脏所包围胃内壁亦有角质乳突胃黏膜上分泌盐酸，故胃液呈酸性，胃的幽门括约肌相当发达，在幽门出收缩明显从幽门以后，依次是十二指肠，小肠，大肠和直肠。十二指肠占整个消化道长度的八分之一，小肠是整个消化道中最长的一部分，几乎占总长度的一半，在小肠与大肠衔接处有膨大的一对盲肠，在食植性龟类较发达，具有消化植物纤维的作用，在直肠的尽端是肛门，开口在泄殖腔。龟类的泄殖孔成星裂状，龟的泄殖腔两侧各具有一个肛囊，常储存积水液，也就是平日把龟从水中拿出，泄殖孔会留出水液。泄殖腔还有从粪便中吸收水分的作用。
肝是最大的消化腺，呈黑色，左右两叶，右叶内有绿色的胆囊，贮存胆汁，并由胆导管通向十二指肠。
胰腺呈乳黄色，紧靠十二指肠，位于肠胃之间的空隙处，有胰导管通向十二指肠，与胆汁一起帮助消化。
脾脏为仅此于肝脏的消化腺，靠在大肠的起点处，呈红色，是淋巴系统。
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