馆址位于铜仁市万山区万镇土坪社区，由原贵州汞矿三栋建筑(贵州汞矿科学文化中心、苏联专家楼、贵州汞矿大礼堂)改建而成。

科学文化中心为博物馆主体建筑，该大楼为砖混四层楼房，建筑面积3200余平方米，一楼为序厅，设有形象墙、沙盘模型、贵宾室、多功能厅、会议室、办公区；

二楼为陈列厅，主要陈列、展示世界和中国汞矿资源分布情况及万山汞矿采冶历史，重点为贵州汞矿历史及产品；三楼为演示厅，主要陈列、展示万山地域的民族风情、人文景观及自然资源。

博物馆共有固定资产3120万元，藏品325件，各种图片、图表、说明58张（幅）。博物馆位于“国保”单位万山汞矿遗址的核心保护区域，它的建成对于万山汞矿遗址的保护利用发挥了极其重要的作用。

博物馆自2008年5月1日开馆以来，截止2011年12月31日，已接待游客184520人次，各类团队407个。
博物馆为现有员工17人，其中管理人员2人、技术人员3人，安全保卫人员4人、卫生保洁人员1人、设备维护维修人员2人、讲解员5人。