资源网站
数据库
NCBI http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
EBI http://www.ebi.ac.uk/
DDBJ http://www.ddbj.nig.ac.jp/
GenBank http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank
EST表达序列标签 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/index.html
UniGene http://www.ncbi.nlm.nih.gov/unigene/statistics/
TSA http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/TSA.html
Third Party Annotation 第三方提供注释 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tpa
dbSTS数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTS/index.html
dbGSS数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbGSS/index.html
HTGS数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/HTGS/
Genome基因组数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomehttp://genomesonline.org/cgi-bin/GOLD/index.cgi
Assembly：各种基因组拼接的不同版本及信息 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly
BioProject：提交到NCBI的各种数据的项目描述 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject
BioSample：提交到NCBI的各种数据的样品描述 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample
dbSNP单核苷酸多态性数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp
dbVar基因组结构变异数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbvar
ENA 同genbank http://www.ebi.ac.uk/ena/
DDBJ同genbank http://www.ddbj.nig.ac.jp/
EPD启动子数据库 http://www.epd.isb-sib.ch/
miRNA数据库 http://www.mirbase.org/
蛋白质数据库
UniProt http://www.uniprot.org/
PIR http://pir.georgetown.edu
PRF http://www.prf.or.jp/
PDBSTR http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bfind?pdbstr
Prosite http://www.expasy.org/prosite
结构数据库
PDB http://www.rcsb.org
NDB http://ndbserver.rutgers.edu
PDIdb http://melolab.org/pdidb
酶和代谢数据库
KEGG http://www.genome.ad.jp/kegg/
PKR http://pkr.genomics.purdue.edu/pkr/
Taxonomy数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html
文献数据库
pubmed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/
OMIM http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim
Agricola http://agricola.nal.usda.gov/
Google Scholar https://www.google.com.hk/https://www.google.com.tw/
序列检索
BLAST http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
primer-blast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/
Constraint-based Multiple Alignment Tool http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/cobalt/
SNP BLAST http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_SPEC=SNP&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on
FASTA 检索 http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/
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NCBI http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
EBI http://www.ebi.ac.uk/
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UniGene http://www.ncbi.nlm.nih.gov/unigene/statistics/
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dbSNP单核苷酸多态性数据库 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp
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EPD启动子数据库 http://www.epd.isb-sib.ch/
miRNA数据库 http://www.mirbase.org/
蛋白质数据库
UniProt http://www.uniprot.org/
PIR http://pir.georgetown.edu
PRF http://www.prf.or.jp/
PDBSTR http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bfind?pdbstr
Prosite http://www.expasy.org/prosite
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PDB http://www.rcsb.org
NDB http://ndbserver.rutgers.edu
PDIdb http://melolab.org/pdidb
酶和代谢数据库
KEGG http://www.genome.ad.jp/kegg/
PKR http://pkr.genomics.purdue.edu/pkr/
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Agricola http://agricola.nal.usda.gov/
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序列检索
BLAST http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/
primer-blast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/
Constraint-based Multiple Alignment Tool http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/cobalt/
SNP BLAST http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&BLAST_SPEC=SNP&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on
FASTA 检索 http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/
