输尿管结石的病因主要有一下几种：
　　输尿管结石病因一：高钙血症诱发的并发症
　　这是钙性结石得诱发因素。小儿尿石症中较常见的是草酸钙，可能并发于高钙血症，如甲状旁腺功能亢进、类肉瘤病、长期卧床、维生素D过高等。
　　输尿管结石病因二：胱氨酸
　　专家介绍，胱氨酸结石约占泌尿系结石的1%，是先天遗传性的肾小管功能缺陷性疾病。因肾小管对胱氨酸、赖氨酸、精氨酸和鸟氨酸的重吸收不良，以致尿内的浓度过高，仅胱氨酸能形成结石。
　　输尿管结石病因三：细菌感染
　　能分解尿素的细菌所引起的泌尿系感染造成尿碱化及产生过多的氨导致积坠成磷酸钙胺和磷酸钙结石。该结石因为异物引起梗阻，结石也常与细菌密切相关致使持续出现尿路感染。
　　输尿管结石病因四：尿高尿酸、尿量少和持久性酸性尿
　　临床发现，尿酸结石约占泌尿系结石的5%至10%。尿高尿酸、尿量少和持久性酸性尿是促进尿酸结石形成的因素。