商合杭铁路全线计划设30个车站。河南段设立商丘、商丘新区2个车站,安徽、浙江段一共是28个车站,其中新建芦庙、亳州南、古城东、太和东、阜阳西、颍上北、凤台南、寿县、淮南南、巢湖北、含山西、芜湖北、郎溪、广德南、安吉等15个车站,改扩建既有的合蚌客专水家湖、合宁铁路肥东、合福高铁巢湖东、宁杭客专湖州站等4个车站。
此外,商合杭高铁还将利用既有的合蚌客专合肥北城、合宁铁路合肥、三十里铺,宁杭铁路德清、杭州东等5个车站,利用在建的宁安铁路、皖赣铁路扩能改造工程芜湖至宣城段新双线芜湖、弋江、湾沚南、宣城等4个车站。
此外,商合杭高铁还将利用既有的合蚌客专合肥北城、合宁铁路合肥、三十里铺,宁杭铁路德清、杭州东等5个车站,利用在建的宁安铁路、皖赣铁路扩能改造工程芜湖至宣城段新双线芜湖、弋江、湾沚南、宣城等4个车站。