恭宗赵上表投降元朝。三月,元统帅伯颜将南宋的谢、全两位太后、帝、诸大臣以及三学学生等,俘虏北上。 其中,后宫一宋恭宗德佑二年即元世祖至元十三年（1276)正月，元军入南宋临安府（今浙江杭州）。为了从精神文化上消除前宋遗留的影响，巩固元朝在江南的统治地位，元世祖于至元十四年（1277）二月即“诏以僧亢吉祥、怜真加、加瓦并为江南总摄，掌释教”。怜真加即杨琏真伽，杨氏为藏传佛教僧人，族属西夏，是最早被派驻到江南杭州的元廷高级僧吏之一。据飞来峰造像题记，他的职衔为“江淮诸路释教都总统”，杨琏真伽在任期间，大弘圣化，将藏传佛教带入了杭州，且加以大力推广。杨琏真伽之后，出生于西夏故地的译经大师、藏传佛教学问僧沙罗巴（1259—1314年）曾先后出任江浙与福建等处的释教总统。另据藏文史籍《汉藏史集》，帝师八思巴又派他的亲传弟子持律却吉衮布到江南传法，一年之中为947人授戒剃度，传出无数比丘、僧伽，使得佛教在江南大为兴盛。随着藏传佛教僧人的弘法活动，为元皇室高度重视与极力推崇的藏传佛教迅速在江南地区兴盛起来。作为南宋故都、元初江淮释教都总统所与行宣政院所在地的杭州，遂成为元代南方藏传佛教弘传的中心。如今，有史料明确可考的元代藏传寺院仅有建于凤凰山南宋大内遗址上的尊胜寺（亦称万寿尊胜塔寺）、西兴天元寺与吴山宝成寺这寥寥几座。除吴山宝成寺外，其余的藏传佛寺均己毁没。宝石山是否建过藏传佛教寺院，现已难以确认，但从相关史料看，元代西湖宝石山一带确有藏传佛教活动的迹象。