众所周知3代后zero用贤者的遗产建立了爱国者组织，来实现theboss的理想。但后来bigboss和zero想法不同，从此离开了爱国者出来单干。但在和平行者，原爆点与4代结局给我们的观念是bigboss对抗zero创造的黑化爱国者ai和zero创立的神秘组织cipher，使我们误认为zero和bigboss关系恶化到仇敌的关系，但真正摧毁msf却是骷髅脸领导的xof与cipher。而在幻痛中曾说过zero病重，骷髅脸拥有大权，并和zero理想不同，zero想统一世界，骷髅脸有过去悲残精历想解放由英语统治的世界，这样真正敌人是骷髅脸领导的cipher，而零与bigboss并非仇敌，而是一种微妙互助关系，并未翻脸。5代最后说过山猫说kaz有一天会回到cipher，但kaz和骷髅脸又不共戴天之仇，kaz也许是zero的人，就连山猫也是爱国者的人来协助boss，但山猫是何方神圣不作评价，毕竟谁也说不清他为谁服务。而且原爆点boss昏迷，zero将他送进医院整容保护直到骷髅脸派人袭击，这都是有力证据。在e3 2015预告片中boss亲口说出“zero称他为魔童计划”也许在boss默认下进行。但在后期zero老了，谁也不相信，创造爱国者ai维护世界秩序，而ai随zero年老失去维护而黑化，boss起义反抗，最后依靠利奎得意识的山猫欺骗系统，solid snake摧毁了系统，这才是4代结局，bigboss出现，解释了一切死去。