黄连、干姜二药配伍主要功效：散寒泻热，调和肠胃。用于肠胃失调，寒热错杂，脘腹痞满，呕吐泄泻，痢疾等。黄连味苦性寒，为清热燥湿、泻火之要药，功能清肠胃以除湿热，清心胃以泻火除烦，清积热，开痞结，有清热不恋湿，祛湿不助热之妙。干姜温燥辛散，为温中、温肺要药，功能温脾散里寒，回阳通脉，温肺化饮。二药合用，一辛一苦，辛开苦降；一寒一温，寒温并施。有散寒泻热、燥湿止泻的综合作用。
临证常用于：1、胃痞、胃痛，寒热中阻，肠胃不和，互结心下之脘痞腹胀或腹痛，呕吐，肠鸣不利等；2、泄泻、痢疾，寒热错杂，下痢赤白等。