隐形粉红独角兽这一概念可能主要依靠网络文化而传播开来：目前已知IPU一词最早于1990年7月7日出现在Usenet的一个新闻组alt.atheism上。目前IPU一词在alt.atheism上仍然十分常用。为数不少的其他网站也开始使用这一概念。
1994至1995年间，一群ISCABBS上的大学生对隐形粉红独角兽这一概念进行了极大的扩展。这些学生发表了一个宣言，基于隐形粉红独角兽创造了一个荒谬的（但又是符合逻辑的）宗教。以下这段引言就反映了IPU的起源：
隐形粉红独角兽是一种拥有超然力量的生物。我们之所以知道它们拥有超然力量，是因为它们可以同时保持不可见和粉红色这两个状态。和所有宗教一样，对隐形粉红独角兽的信仰是基于逻辑和信念的。我们的信念认为它们是粉红色的；而我们的逻辑认为它们是不可见的，因为我们见不着它们。
—史蒂夫·埃利（美国思辨小说作家）
2007年，作家妮娅姆·华莱士撰文认为隐形粉红独角兽已经成为了无神论的象征符号之一。