根腐病发病原因主要是：
1、土壤带菌；
2、连茬苗木带菌；
3、过量施用化肥，使土壤板结、酸化发病；
4、过量灌水，使土壤透气性差而发病；
5、管理不当，干旱、缺少有机肥、环剥过重、结果过多，使树势衰弱而诱发病害。
根腐病发生时，一般只有地上部症状明显时才能发现，此时治疗为时已晚。地上部症状出现后，树体即丧失结果能力，如果不及时治疗将逐步衰弱死亡，挖后重栽则可能引起侵染甚至毁园。
过去防治根腐病主要侧重于药剂灌根，成本较高，有效期短，易于复发。经多年观察实验，改良土壤、生物防治是治愈果树根腐病的唯一有效途径。