出家之后法号崇永的氏赖，在文和三年（1354）之后接受幕府的命令，再次出任近江守护。贞治四年（1365）十一月，义信先氏赖而去。失去继承者的氏赖，选择迎入京极高秀之子高经作为养子。但是，在应安二年（1369），氏赖的幼子（龟寿丸，后来的满高）出生。应安三年（1370），氏赖去世，高经以“在龟寿丸成年之后退位”的条件继承六角氏。永和三年（1377）九月，管领细川赖之以“非法”的理由剥夺了高经的家督之位并将其驱逐回京极（《花营三代记》）。这件事的背后，是幕府内部细川赖之与斯波义将的权力斗争。而高经的父亲高秀是义将的盟友（《八日市市史》二）。因此，在康历元年（1379）细川赖之向六角满高发布了针对京极高秀的追讨御教书。而满高则攻击了高秀的领地犬上郡甲良庄（甲良町）（《后愚昧记》）。
应永二十三年（1416）十一月，六角满高逝世，作为六角家惣领统治近四十年。在应永十七年（1410）十二月，满高曾因拒绝出兵讨伐飞驒国司姊小路氏而被将军足利义持免去近江守护职，由青木持通接任（《青木文书》）。但在应永二十年以后，满高再次成为近江守护。六角氏的屡次复位，应是幕府无力改变现状，对现实妥协的结果。