一星级消毒标准
能杀死大肠杆菌等具有代表性的菌种。臭氧消毒时，消毒柜内臭氧浓度应大于等于每立方米20毫克，消毒时间应大于等于30分钟；高温消毒时，消毒柜内消毒温度应大于等于100摄氏度，消毒时间应大于等于15分钟。
二星级消毒标准
除能消灭大肠杆菌外，消毒对象还有“脊髓灰质炎病毒”等具有代表性的菌种。臭氧消毒时，消毒柜内臭氧浓度应大于等于每立方米40毫克，消毒时间应大于等于60分钟；高温消毒时，消毒柜内消毒温度应大于等于120摄氏度，消毒时间应大于等于15分钟
新国标在“标志和说明”一节中明确规定：消毒柜的正面位置应标有消毒柜消毒等级，用以提示不同的消毒效果。消毒柜最少应有一个室的消毒效果达到量级要求。一星级消毒柜（室）用消毒星级“*”标示；二星级消毒柜（室）用消毒星级“**”标示。达不到消毒柜消毒等级的消毒室不得使用“消毒星级”标志，并注明该室的使用功能。